入职签订了协议不满一个月扣除一半工资合法吗

不合法。依据《劳动法》，工资应按时足额支付，不得无故克扣。《劳动法》规定，雇主需保障员工工资权益，扣除一半工资违反了此原则，可能导致员工生活困难及法律纠纷。
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常见处理方式为协商或申请劳动仲裁。应先尝试与公司协商，若协商无果，可向劳动仲裁委员会提起仲裁，维护自身合法权益。选择时需考虑效率与成本，仲裁虽耗时但具有法律效力。
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不合法，应维权。具体操作：1.与公司沟通，要求解释扣款原因并提供依据；2.若沟通无果，收集证据，如工资条、协议等；3.向劳动仲裁委提交仲裁申请，附上证据材料；4.等待仲裁结果，必要时可诉诸法院。